全自动生化分析仪发展迅速，具有多项目、多样本的处理能力，检测速度不断的提高，但由于共用吸样针、试剂针、搅拌棒以及比色杯，当生化仪长期使用致其清洗能力下降、比色杯老化后引起吸附力增加、生化仪内污垢的积聚、测试顺序安排不当，且常规清洗不能有效消除交叉污染时，就会增加试剂间化学污染的可能性，引起测定结果不准确。

1、试剂针污染：目前大多数全自动生化分析仪采用双试剂检测样本，试剂R1、R2的吸取与吐出，一般分别只配有一套试剂针。当试剂针在清洗不完全，或黏附力增加时，残留试剂可能会对下一相临检测结果造成影响。

2、搅拌棒污染：在试剂与样本混合后，往往需要搅拌棒加以混匀，而搅拌绑若清洗不完全，或黏附力增加时，残留试剂可能会对下一相临检测结果造成影响。

3、比色杯污染：生化分析仪的比色杯一般是循环使用的，每个比色杯检测完毕后，进行清洗，然后继续下一个检测项目的检测。当某个比色杯清洗不完全时，吸附在比色杯上的上一个项目的残留试剂，可能会对在这个比色杯中进行的下一个项目的检测结果造成影响。

以上三种可能的污染，以比色杯污染较为严重，因此比色杯难以清洗干净，且在实际工作中难以判断该比色杯上一测试的项目；试剂针吸量较大，亦难以清洗干净。